一、名詞解釋：(25%) &|LP>'H;
1、RFLP:限制性片段長度多態性，是由DNA變異(產生新的酶切位點或消除原有的酶切位點)導致在限制性核酸內切酶酶切時產生不同的長度片段。可借助Southern Blotting或PCR的方法進行檢測。 4(hHp6}b
2、SSR：簡章序列重復多態性，引物是根據微衛星DNA重復序列兩翼的特定短序列設計，用來擴增重復序列本身。由于重復的長度變化極大，所以是檢測多態性的一種有效方法。其特點包括：一般檢測到的是一個單一的多等位基因位點，共顯性遺傳，故可鑒別雜合子與純合子；得到的結果重復性很高。 3[a&|!Yw
3、EST：表達序列標簽，是指從不同的組織構建的cDNA文庫中，隨機挑選不同的克隆，進行克隆的部分測序所產生的cDNA序列。隨著高通量測序技術的進步，使人們越來越相信，大規模地產生EST，結合生物信息學的手段，將為人們提供一種快速有效的發現新基因的方法。 e=).0S`*F
4、STS：序列標簽位點，是由特定引物序列所界定的一類標記的統稱，短的在基因組上是可以被唯一操作的序列，因而可以確定在物理圖譜上的特定位置。 h k7kg/"
5、CAP: CAP即分解代謝物基因活化蛋白是一種激活蛋白，因為細菌的許多啟動子為弱啟動子，本身與RNA聚合酶的作用較弱，在有CAP蛋白這類激活蛋白存在下，可使RNA聚合酶與啟動子的親和力增強，CAP蛋白的活性強烈依賴cAMP。 1p DL()t
6、AFLP：擴增片段長度多態性，其特點是把RFLP和PCR結合了起來。其基本步驟是：把DNA進行限制性內切酶酶切，然后選擇特定的片段進行PCR擴增(在所有的限制性片段兩端加上帶有特定序列的“接頭”，用與接頭互補的但3?端有幾個隨機選擇的核苷酸的引物進行特異PCR擴增，只有那些與3?端嚴格配對的片段才能得到擴增)，再在有高分辨力的測序膠上分開這些擴增產物，用放射性法、熒光法或銀染染色法均可檢測之。 M In6p
7、SNP：單核苷酸多態性，是一種較為新型的分子標記，其依據的是一位點的不同等位基因之間常常只有一個或幾個核苷酸的差異，因此在分子水平上對單個核苷酸的差異進行檢測是很有意義的。 Z2t
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8、FISH：熒光原位雜交技術，是一種利用非放射性的熒光信號對原位雜交樣本進行檢測的技術。它將熒光信號的高靈敏度、安全性，熒光信號的直觀性和原位雜交的高準確性結合起來，通過熒光標記的DNA探針與待測樣本的DNA進行原位雜交，在熒光顯微鏡下對熒光信號進行辨別和計數，從而對染色體或基因異常的細胞、組織樣本進行檢測和診斷，為各種基因相關疾病的分型、預前和預后提供準確的依據。 `:4bg1u
9、Genome：基因組，有機體或細胞中的所有DNA，包括核中的染色體和線粒體中的DNA。 u~-,kF@
10、RNA in situ hybridization：RNA原位雜交，是利用cDNA為探針來檢測與其互補的mRNA鏈在細菌或其他真核細胞中的位置，是檢測基因組織特性表達的常用方法。 h%0FKi^
11、單克隆抗體：每個B淋巴細胞有合成一種抗體的遺傳基因。動物脾臟有上百萬種不同的B淋巴細胞系，含遺傳基因不同的B淋巴細胞合成不同的抗體。當機體受抗原刺激時，抗原分子上的許多決定簇分別激活各個具有不同基因的B細胞。被激活的B細胞分裂增殖形成該細胞的子孫，即克隆由許多個被激活B細胞的分裂增殖形成多克隆，并合成多種抗體。如果能選出一個制造一種專一抗體的細胞進行培養，就可得到由單細胞經分裂增殖而形成細胞群，即單克隆。單克隆細胞將合成一種決定簇的抗體，稱為單克隆抗體。 f-'$tMs
12、基因芯片：所謂基因芯片，是指將大量探針分子固定于支持物，上，然后與標記的樣品進行雜交，通過檢測雜交信號的強弱進而判斷樣品中靶分子的數量。由于用該技術可以將極其大量的探針同時固定于支持物上，所以一次可以對大量的DNA分子或RNA分子進行檢測分析，從而解決了傳統核酸印跡雜交，技術復雜、自動化程度低、檢測目的分子數量少、效率低，等不足，而且，通過設計不同的探針陣列，，用一定的分析方法，還可以用于序列分析，稱作雜交測序。 q '
二、描述cDNA文庫構建原理與方法（25%）：（1）cDNA獲得方法，（2）克隆方法，（3）文庫質量定義。 z^YL$
答： cDNA：以mRNA為模板，利用反轉錄酶合成與mRNA互補的DNA(complementary DNA，cDNA)，再復制成雙鏈cDNA片段，與適當載體連接后轉入受菌體，擴增為cDNA文庫(cDNA library)，然后再采用適當方法從cDNA文庫種篩選出目的cDNA。與基因組DNA文庫類似，由總mRNA制作的cDNA文庫包括了細胞全部mRNA信息，自然也含有我們感興趣的編碼cDNA。當前發現的大多數蛋白質的編碼基因幾乎都是這樣分離的。 8
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（1） cDNA獲得方法：①Total RNA的提��；②mRNA的分離；③cDNA雙鏈合成：Superscipt II—RT合成第一鏈，cDNA第二鏈的合成，雙鏈cDNA末端補平，EcoR I adaptor 加接，雙鏈cDNA末端的磷酸化及Xho I酶切，膠回收cDNA。 8K;wX%_,
（2） 克隆方法：①載體制備：pBlueScriptII的提取，pBlueScriptII的雙酶切消化，載體去磷酸化，載體效率檢測；②cDNA雙鏈和載體的連接：連接，檢測（PCR方法）；③電轉化：電轉化感受態細胞的制備，連接產物純化，電轉化；④快速鑒定、菌落PCR⑤pBlueScript cDNA文庫擴增。 f'-)
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（3） 文庫質量定義：評價一個文庫是否有實用價值主要在于文庫的含量和插入片段的大小兩個方面。所構建的文庫中必須有足夠多的克隆數, 這樣才能確�；蚪McDNA 中的每一個序列至少有一個拷貝存在于重組文庫中, 為達到這一要求, 文庫的容量應不小于1.7×105 , 同時為保證cDNA片段的完整性, 插入片段的平均大小應不小于1kb。 aP}%&{iC*
三、闡述基因突變的概念及引起突變的可能途徑(25%)：（1）化學誘變，（2）物理誘變，（3）T-DNA插入，（4）缺失、插入，（5）無意突變概念，（6）堿基修復概念 -g zY ~a
答：基因突變 屬分子水平上的變異,是指染色體上個別基因所發生的分子結構的變化，基因突變在自然界普遍存在。 3v:c".O2O
基因突變的方式很多，主要有：（1）化學誘變，基因突變可以由某些化學物質所引起，這些化學物質稱為化學誘變劑�，F已知很多的化學誘變劑，它們誘變的機制是不同的。在DNA復制過程由于堿基類似物的取代，堿基的化學修飾以及堿基的插入和缺失都會引起突變。（2）物理誘變，利用物理因素引起基因突變的稱物理誘變，如X射線、紫外線、電離輻射等物理因素可造成 （3）T-DNA插入，改變讀碼或變成假基因。（4）移碼突變：基因中插入或者缺失一個或幾個堿基對，會使DNA的閱讀框架（讀碼框）發生改變，導致插入或缺失部位之后的所有密碼子都跟著發生變化，結果產生一種異常的多肽鏈。移碼突變誘發的原因是一些像吖啶類染料分子能插入DNA分子，使DNA復制時發生差錯，導致移碼突變。（5）無意突變，由于一對或幾對堿基對的改變而使決定某一氨基酸的密碼子變成一個終止密碼子的基因突變。（6）堿基修復：DNA損傷的修復系統主要有以下幾個：①損傷堿基的直接修復；②切除修復，包括堿基切除修復、核苷酸切除修復和DNA交鏈的切除修復；③錯配修復；④重組修復，又稱復制后修復；⑤跨損傷DNA合成，這是一種利用損傷核苷酸為模板，通過DNA聚合酶I使堿基摻入到復制終止處進行DNA合成，從而延長DNA鏈的修復。 }8\"oA6
基因突變的特點為： RO9oO7
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第一，基因突變在生物界中是普遍存在的。 rjJ-ZRs\
第二，基因突變是隨機發生的。 J]=2] oI2
第三，在自然狀態下，對一種生物來說，基因突變的頻率是很低的。 gL
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第四，大多數基因突變對生物體是有害的，由于任何一種生物都是長期進化過程的產物，它們與環境條件已經取得了高度的協調。 TXDb5ZCzM
第五，基因突變是不定向的。 \NN5'DBx
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四、闡述一條反向遺傳克隆功能基因的途徑(25%) UB7H`)C}
答：反向遺傳學是相對于經典遺傳學而言的。經典遺傳學是從生物的性狀、表型到遺傳物質來研究生命的發生與發展規律。反向遺傳學則是在獲得生物體基因組全部序列的基礎上，通過對靶基因進行必要的加工和修飾，如定點突變、基因插入\缺失、基因置換等，再按組成順序構建含生物體必需元件的修飾基因組，讓其裝配出具有生命活性的個體，研究生物體基因組的結構與功能，以及這些修飾可能對生物體的表型、性狀有何種影響等方面的內容。 }ippi6b:r
比較典型的反向遺傳克隆功能基因的途徑如RNAi。 jh*aD=y
RNAi的機制可能是細胞內雙鏈RNA在Dicer酶的作用下，可形成-22 bp大小的小干擾RNA(small interfering RNAs，siRNAs)，siRNAs可進一步摻入多組分核酸酶并使其激活，從而精確降解與siRNAs序列相同的mRNA，完全抑制了該基因在細胞內的翻譯和表達(下略)。
